依照法律拘捕东铁集团首脑时，特搜组干警江Sir（任达华 饰）遇到神秘女子叶风（张敏 饰），开枪击落她的手掌，叶风丢下铁手掌离去，江Sir怀疑她是机器人，开始特别留意她的行踪。高杰（袁咏仪 饰）率四名助手于某夜潜入东铁集团大楼准备盗取宝物秦黄石，要到手时，遇到也为秦皇石而来的叶风，两人展开争夺，高杰携石逃走。江Sir奉命追查此案，但效果令东铁集团新首脑龙羽（黄志强 饰）与得力助手由田哲（李健生 饰）颇为不满，两人开始追杀叶风和高杰众人，但江Sir没放弃尽职尽责。追逐中，神秘的叶风和江Sir渐渐生出感情，而他们两人又与高杰和东铁集团一干人展开四角争夺战，敌我关系一时复杂难辨。

　　王启聪（陈奕迅 饰）和李耀庭（郭富城 饰）是互不认识的重案组探员。聪大大咧咧不修边幅，庭辣手灵敏自命不凡。两个性格各异的警界精英因为一宗案件聚到一起，女警冯宝宝（郑希怡 饰）暂时成为他们的上司。
　　这宗案件由KEN（黄品源 饰）引发，他和女友打算盗窃一件价值连城的珠宝，还商量到手后就隐退江湖。结果却是螳螂捕蝉黄雀在后，他们盗来的宝物被另一伙人看上，他们追杀并捉走了KEN，女友则带着珠宝幸得逃走。她向警方提出要求：她愿意用这条项链，换回KEN的安全回来。
　　警方开始追查绑架KEN的黑帮。其间聪、庭和冯宝宝却意见各异冲突不断。案件的侦破困难重重。

　　韩国秘密核武器神秘失踪，同时载着军方手提装置的飞机在中国境内坠毁。韩方接到消息，一名疑似绰号“赤道”的危险人物（张震 饰）带着助手“信差”（文咏珊 饰）将于香港实行秘密武器交易，韩国武器专家崔民号（池珍熙 饰）与特工朴宇哲（崔始源 饰）奉命前往调查。香港反恐特勤组主管李彦 明（张家辉 饰）与督察范家明（余文乐 饰）协助韩方寻找武器，而核物理教授肇志仁（张学友 饰）也受邀协助判案。武器很快被寻回，没想到竟还隐藏着潜在危机。正当香港及韩国警方决定送还武器回韩国之际，大陆安全局高管（王学圻 饰）带着助手袁小姐（冯文娟 饰）突然出现，三方陷入周旋之中，原来“赤道”另有其人，而他们一伙儿的阴谋也开始实施……