ICAC首席调查主任陆志廉（古天乐 饰）与总调查主任程德明（郑嘉颖 饰）共同调查走私贪污案，意外发现另一起涉及人口贩卖的海关贪腐大案。此案与恐袭集团首脑King及其幕后指使人肖卓亚（谢天华 饰）有关，并牵涉多名香港海关高层领导，且似乎与受邀到香港、被JFIU廖保强（张智霖 饰）秘密保护的亚洲首席大法官庞爱玛（宣萱 饰）也有联系。暗流涌动、扑朔迷离，真相究竟何时浮现……

　　恐怖组织“瓦干布”渗透香港，在香港掀起一场化武争夺战，飞虎队总指挥范少锋（陈豪 饰）临危受命，率飞虎队与恐怖分子斗智斗勇。飞虎队身陷瓦干布的无情杀局，特勤队警司展博文（马德钟 饰）召集警界精英张伟桦（张兆辉 饰）、张嘉轩（黄宗泽 饰）和高子乐（吴卓羲 饰）成立秘密反恐小组S Team。面对重重危机，在国际刑警许俊飞（苗侨伟 饰）的协助下，中青两代最终放下恩怨情仇，联手阻止化武病毒在香港蔓延。