《庚子风云》讲述的是公元1900年及中国历庚子年，八国联军攻占北京，并占领紫禁城，皇太后慈禧为避祸携光绪帝、大阿哥等人仓惶逃离皇宫，来到西安，最后又安全回宫的故事。
　　慈禧太后临行前，由于政治立场不同的仇恨，将光绪皇帝深爱的妃子珍妃推入井中杀害。而当太后历尽千难万险来到古都西安时，却发现当地戏班的花魁白牡丹竟和珍妃长得一模一样！而这位本名斯琴的白牡丹却与在慈禧太后等人逃难至西安这条西行路上，给予了他们莫大帮助的一位从欧洲留洋五年回国的爱国青年陈然有着夙世姻缘，同时她也和陕西巡抚韩雨轩同样有着千丝万缕的关系。

　　故事发生在清朝初年，礼部尚书彭鹏（李进荣 饰）被康熙千里迢迢派往广西平息叛乱，这漫长的旅途中，隐藏着无数的危险，亦有无数的牛鬼蛇神想要取彭鹏的性命。然而，在彭鹏的背后，有着一干侠肝义胆的朋友们扶持，他们自愿担负起了保护彭鹏生命安全的职责，而怪侠欧阳德（小沈阳 饰）的身影在其中显得尤为滑稽怪异。
　　淳贝勒（叶祖新 饰）是福郡王的儿子，整日不学无术仗势欺人，最终闯下大祸。秋馆（王耿豪 饰）于无意之中得知了事件的真相，遂遭到了淳贝勒派出的杀手的猛烈袭击，正当命悬一线之时，又是欧阳德出手相救才逃过一劫。彭鹏顺利上任，欧阳德、杨香武（张亮 饰）和黄天霸（林江国 饰）成为了他可靠的左膀右臂。

　　铸剑大师欧冶子舍生取义，帮助正直淳良的青年干将前往楚国铸剑，并借机刺杀穷兵黩武的无道暴君。而干将与莫邪的爱情经历了阴谋与误会的考验，也更加坚贞不渝，富于传奇色彩……干将被楚王杀害后，莫邪带着儿子眉间赤隐姓埋名、忍辱偷生。十八年后，在爱人青萝君和母亲相继遇害之后，赤知道了真相，燃起了复仇的勇气。亦师亦友的山中客，目睹了赤的遭遇，决定帮助赤完成复仇……

　　长安少侠乐无异（王力宏 饰），为追寻偃甲大师谢衣（高圣远 饰）的下落，与富家公子夏夷则（高以翔 饰）和百草谷天罡战士闻人羽（宋茜 饰）在海市博卖行相遇，并意外牵涉进流月城大祭司沈夜（张智霖 饰）与心魔企图毁灭人类的惊天交易中。欲消灭心魔，必重铸昭明神剑，乐无异、闻人羽、夏夷则在谢衣的提示下，找到封印在画中的神秘少女阿阮（吴千语 饰），并同她一起踏上寻剑之旅。一场斩杀心魔，拯救苍生的正义之战就此展开……

　　影片将干将莫邪之间坚贞不渝的爱情、眉间赤与山中客之间的侠义之情进行融合，同时还将铸剑及恢弘的武侠世界进行呈现。

　　梁坤和青梅竹马的爱人、兄弟自小被当地恶霸胡大海欺压，为保护爱人和兄弟，梁坤毅然奔赴少林苦学武功，学成下山后，胡大海对其和好友更加变本加厉，犯下不可饶恕的罪行。面对至亲被虐杀，梁坤陷入暴走边缘，苦练武功决心复仇。却掉入仇人的陷阱之中······

　　战乱时期，江湖上五大毒宗拔地而起，五大毒宗对应着生活中的五毒。圣鳞教教主南宫懿为满足自己私心，抢夺各门派武功秘籍。一个毫无征兆的夜晚，狂风四起。天龙门掌门失踪，金乌派惨遭灭门，天蟾谷一夜间彻底消失。天蟾谷掌门幼子独孤俞在被追杀的过程中被谷中长老独孤仲使出蛤蟆神功所救，并由一农村老妇抚养，是为奶奶。十八年后。独孤俞结识了南宫翎，两人互生情愫，却没想到是大仇人南宫懿的女儿，而南宫懿十八年来一直在寻找独孤俞。独孤俞被抓，翎翎冒死救出，一次意外独孤俞坠崖练成了蛤蟆神功。独孤俞前去找南宫懿报仇，南宫翎为了终止这场大战牺牲了自己，南宫懿亲手杀死了自己最爱的女儿，走火入魔，成了疯子。最终独孤俞也放下了恩怨。

飞云镖局的二当家姚仙在三年前因在押镖的途中遇到一个少年被众人追杀，心生怜悯之心而救了这个少年，也因此得罪了武林黑道。从此之后镖局经常失镖，而飞云镖局的生意也越来越差。三年后的今天，同样是二当家押的镖又被黑道劫走，并抓了二当家的，此时一位壮士出手相救。回到镖局后才知这位壮士正是二当家当年救下的少年君

　　江湖之中一直有一个传说，谁人能得到孤刀残剑，谁人就能习的上乘武功，武林之中便再无敌手，成为武林至尊，可没人知道孤刀残剑的藏匿地点，就单单为了一张孤刀残剑的地图，每个武林中人都各怀鬼胎，四处拼杀寻找地图的下落，只有武林盟主処天极从蛮人手中获得了地图更是想据为己有，谁料藏匿地点有一相当厉害的高手在看守孤刀残剑，処天极屡战屡败，只好设计将地图信息让画家用画展的方式透漏到江湖中去，自然有更厉害的高手前去挑战，等双方两败俱伤好从中浑水摸鱼，半路再截取孤刀残剑，可惜処天极计划失败，被一个叫狗嗨的愣头青，从村里出来闯荡江湖的路上给破坏了，狗嗨成了唯一看过地图信息的人。