TVアニメ「Free!－Dive to the Future－」を再構築し、新規エピソードを追加した劇場版。

　　净化烦恼吧。为了普救世人而面向烦恼！降临于现世的佛，喧闹的共同生活！？接受了释迦如来的使命，降临于现世的帝释天和梵天。他们的使命，是从烦恼的化身·魔罗手中保护人们！他们与释迦如来所率领的十三尊佛一起开始了在梵纳寺的共同生活。一碰面就总是互相唱反调的帝释天与梵天。由于过去发生的“某个事件”，两人之间产生了巨大的隔阂。为了从烦恼中普救世人而奋斗的两大护法善神，帝释天与梵天以及在一己之道上狂奔的阿修罗的物语，现在开始！

　　讲述天才发明家的小学生·狸猫，因事故而失去了心爱的姐姐，由狸猫开发的“姐姐·机器人”的故事

　　从小就在父亲身上学习到了很多生存技能的鬼岛誉（市道真央 配音）、同时参加了田径部和篮球部的超级运动系少女铃森明日香（河野日和 配音）、拥有高超的智商和好学生的外表，实际上却是一个超级腐女的天谷睦（安野希世乃 配音）、个性傲娇而又毒舌，但实际上非常想要得到大家的认可和喜欢的千金大小姐九条紫音（和气杏未 配音），一场空难中，这四名女子高中生成为了幸存者，并且漂流到了无人岛上。
　　从来都是坐在课堂里学习书本知识的高中生们，该如何应对岛上极为恶劣和极端的情况呢？很快她们便会知道，想要在自然法则里生存下去，就要放弃很多东西。

　　由于机械生命体的袭击，文明崩溃，星星只剩下沙漠和鬼屋了。少年诺亚为了实现帮助那些仅存的动物的梦想，当时，机械化了身体，在严酷的环境中独自生存下来，并制造方舟。在那里，觊觎从另一个世界来的方舟的天圣凯瑟德。我在诺亚寻找夺取方舟的机会，在触及诺亚的直率和温柔中，在目的和友情之间变得摇摆不定。

　　性格大大咧咧，有着无论和谁都能够在短时间里熟络起来的特异功能的笨蛋少女田中望（赤崎千夏 配音）、表面上是傲娇可爱少女，实际上是一个死宅的菊池茜（户松遥 配音）、总是面无表情，没有人知道她脑袋里在想什么的鹭宫诗织（丰崎爱生 配音）、身材非常娇小，对自己的身高分外在意的百井咲久（长绳麻理亚 配音）、中二病到没救的山本美波（富田美忧 配音）、性格非常非常认真，无论什么离谱的事情都会当真的一奏（高桥李依 配音）。
　　故事围绕着这些可爱的女高中生们徐徐展开，她们各异的性格碰撞出一曲异常动人的欢乐交响乐。

　　地方新闻社·新神奈川日报记者泽村政彦（松田龙平 饰）收到了「肇事逃逸事件」的独家新闻素材中提到了痛失丈夫的森本敦子（小芝风花 饰）是肇事者。
　　久违的独家新闻让政彦干劲十足，但却被他大学同期的网络新闻主编 ·三反园（松山研一 饰）指出这是由同事桐野（筒井道隆 饰）所设计的不实报道，政彦追寻着消失了踪影的桐野...

　　在京都居住的内向男高中生直实（北村匠海 配音）的面前，突然出现从10年后穿越而来26岁的自己（松坂桃李 配音）。未来的直实告诉他，自己不久便会与瑠璃（滨边美波 配音）相爱，可是之后烟花大会时她却会因为一场事故意外离世。
　　为了拯救爱人，16岁的直实卷入了这场现实与虚拟的记忆世界，经历了一系列超乎想象的事情。即使世界毁灭，我也想再见你一面。