本片以时局动荡的五代十国时期为背景，讲述了杨继业和佘太君年轻时候的故事：后汉末年，皇位空缺、番邦异动；西北第一要塞麟州城内人人崇武重信，为护送晋商出陕，麟州杨家屡遭暗算，营救途中，得知此人就是当今储君。为稳定中原之势，边塞重镇与契丹拼死力博，虎口救君……

　　混沌初开，人妖并存于世，彼此相安无事。千百年后，幽离族族主暴魅发动战争，要将人类驱逐。奇人异士历经艰辛，将其驱逐至地底深处，并用乾元仙阵镇压。新族主暴貔组织族人世代破阵，仙阵终有破损，幽离族乘机重返人间。平幽司前掌政引导半人半幽离的易水寒集齐五行尊者，重整平幽司。人皮案后，皇帝也下令重启平幽司查明真相。
　　调查期间，易水寒偶遇陆晶灵和蓝靛衣，一个为幽离平反，一个要剿灭幽离，两人一路打闹，让易水寒焦头烂额，好在最后发现二人就是水火尊者。易水寒不仅通过查案找齐了五行尊者，还与忘我医庐的狄青云结成了忘年交。
　　最后，平幽司一行人查明了一切都是李公公的阴谋，他勾结幽离，激化两族矛盾，企图谋权篡位。虽然平幽司查清真相，揭穿了狄青云，但狡猾的李公公却消灭罪证，继续逍遥法外……

　　上元节，繁华的长安城内妖气弥漫，文武百官进宫赴宴，国师凌玄上师与爱徒月半娇也在其中。月半娇隐约见到贵妃变成树妖，不顾师父阻拦将其打倒在地。皇帝大怒，下旨将月半娇押入大牢，月半娇狱中遇到同被关押的青年才子杜子腾，两人逃离监狱后，又结识了青莲剑仙太白先生、青楼杀手十二娘，组成了捉妖小队一同完成除妖救国的大计，但很快他们便发现，长安城危机的背后似乎有人作祟……

　　福州捕头苏剑名奉命来到青山镇办理贩卖假酒一案，巧遇青山镇老大柳轻舟，俩人不打不相识，并被苏剑名识破整个青山镇乃是假酒大本营，苏剑名正欲惩治这起窝案，不料青山镇竟被一帮倭寇重重围堵，来势汹汹的倭寇并未抢劫直接大开杀戒。原来，锦衣卫千户孙百安从倭寇手中盗取一 份朝中人士的通倭名单，只身藏于青山镇内，倭寇追杀至此要屠镇捉人，别无选择的苏剑名决定带领只会制酒的镇民们共同抗敌，双方实力悬殊，等待他们的将是未知的命运

　　天师阁逢妖必除。酒半壶前往降妖，却一去不返。坊间传闻，天师阁一众精英在围猎上古凶兽穷奇时，全军覆没。天师阁从此没落，而流落民间的天放也成了仅存的天师传人。
　　一晃十年，他和失去猫妖记忆的若灵，也在苦中作乐中长大。二人经营起驭妖坊，靠着帮人捉些小妖小怪，勉强度日。若灵对天放情愫渐浓，天放却知人妖殊途，始终不以为意。
　　城中与皇宫接连发生妖怪伤人事件，人心惶惶。天放、若灵怀疑是他们曾遭遇的鼠妖所为。太子怀冲为捉妖设下重金酬劳，天放意外地从怀冲身上发现师父失踪一事的线索，于是两人一起加入怀冲的捉妖队伍……