卫斯理（刘德华）是联合国外星生物分析局的特别成员，负责处理地球上一切和外星生物有关的事件。某次在古董店参观一块奇异的蓝色“人骨”时，卫斯理遇到少时曾有过一面之缘的、外表看来和一般美女无异的、血液是蓝色的外星人方天涯（关芝琳），当他想将其留住时，方天涯消失了。
　　古董店附近 发生了一宗外星生物突袭事件，美国隶属FBI的外星生物调查机构接到上级命令，派出队中精英白素（舒淇）和白奇伟（张耀扬）兄妹领队到现场调查，众人与具有A级战斗力的外星生物展开交战。闻得风声的卫斯理也前来助阵，无奈不敌强大的敌手身受重伤，方天涯及时现身以奇异力量救出卫斯理，两人就此开始一段离奇情缘。

　　徐夕（李连杰）本是神秘杀手组织701部队里的一名冷血杀手，因为不想再做杀人工具，他逃离了该组织来到香港化身为一名普通的图书馆理员，因此结识警察石SIR并与之成为好友，不想701部队为追杀黑帮头目突然现身香港，一时石SIR及警方均束手无策，见好友处于危难中，徐夕挺身而出化 为黑侠。
　　黑侠让701部队的首脑熊菊（龙刚）大为震怒，遂派徐夕旧情人若兰规劝黑侠归顺，被徐夕断然拒绝，结果令图书馆除Tracy（莫文蔚）之外的诸同事皆丧命。为保护Tracy，徐夕再做黑侠采用强硬态度要带她走，遭不知黑侠就是其意中人徐夕的Tracy的拒绝。后在与熊菊一干人等对抗的过程中，徐夕渐从Tracy身上寻到自己想要的情感。

　　著名作家、冒险家卫斯理（许冠杰 饰）在埃及游历时，受到了大富翁霍普的请托，后者请卫斯理寻找他的师兄高大威（泰迪罗宾 饰）。卫斯理在收到高大威主动寄来的信件后，赶赴尼泊尔与其汇合。高大威其时正为青帮龙头白奇伟（狄龙 饰）寻找传说中的喜马拉雅龙珠，眼看成功在即却身陷“邪教”的追杀中，卫斯理帮助高大威潜入宗教内部夺得龙珠，在撤出时飞机失事高大威不知所踪，逃跑失败的卫斯理被带到只有五岁的小佛爷面前，卫斯理受小佛爷感化，承诺追回龙珠，以延续此一教派。
　　返回香港的卫斯理再遇霍普助手，并拒绝向对方交出龙珠，第一时间赶到白公馆，白奇伟之妹白素（王祖贤 饰）是卫斯理的书迷，在白素帮助下，卫斯理取得龙珠，但是一场三方围绕龙珠的争夺战才刚刚开始……

在未来世界，科学家为了要释放人类大脑深层力量，研制了Power Glove。警队精英都来进行测试，最后，只有Dark（郑伊健 饰）、Combat 21（张耀扬 饰）及风雷（元彪 饰）能成功控制Power Glove。但测试当晚，Combat 21把其中一套Power Glove偷去，更将同僚杀光，并与被洗脑的风雷逃去。多年后，Combat 21计划以毒气及其力量来取代政府。这时Dark遇上因救少女Erica（梁咏琪 饰）而得罪赤龙党的山之光（王力宏 饰）及阿飘（杨恭如 饰）。

　　2043年7月1日，犯罪大王将军（卢惠光饰）被捕，一星期后由铁面无私的法官余铁雄（张卫健饰）主审。将军特派其黑社会爪牙健（郑伊健饰）返回50年前寻找铁雄，并将其洗脑使他无法进行审判。政府知情后特派飞龙特警铁面（刘德华饰）、扫帚头（张学友饰）及发达星（任达华饰）返回1993年去保护铁雄。
　　时大雄为93年一中学长期留班生，常遭同学余忌安（许志安饰）作弄毒打，只有女友采妮（杨采妮饰）对他真心。飞龙三特警混进学校，扫帚头当上老师，铁面做大雄同学，星则任大雄跟班，帮大雄打赢忌安，并向他套取铁雄下落，但大雄却表示校内并无铁雄此人。在这时健亦扮成老师混入学校，另一边大雄母亲要改嫁理查德余……最终飞龙特警能完成任务吗？

　　未来世界，地球因环境污染而千疮百孔，人类家园破败萧条。一颗陨石突然撞击地球，并带来杀伤力极强的外星生物，560万人将因此失去生命。人类命运岌岌可危，总指挥李升（张家辉 饰）派出以军人泰来（古天乐 饰）为首的精英部队前往执行改造计划，部队却突遭暴力攻击，只有泰来和通讯兵光仔（万国鹏 饰）幸存。军官谭冰（刘嘉玲 饰）坚持执行PlanB，指挥官郑重生（刘青云 饰）反对并找来旧友臭鼬（姜皓文 饰）前往支援。拯救家园刻不容缓，但在通讯员小绿（吴倩 饰）悄悄提醒下，泰来发现了一个足以毁天灭地的邪恶阴谋……