卫斯理（刘德华）是联合国外星生物分析局的特别成员，负责处理地球上一切和外星生物有关的事件。某次在古董店参观一块奇异的蓝色“人骨”时，卫斯理遇到少时曾有过一面之缘的、外表看来和一般美女无异的、血液是蓝色的外星人方天涯（关芝琳），当他想将其留住时，方天涯消失了。
　　古董店附近 发生了一宗外星生物突袭事件，美国隶属FBI的外星生物调查机构接到上级命令，派出队中精英白素（舒淇）和白奇伟（张耀扬）兄妹领队到现场调查，众人与具有A级战斗力的外星生物展开交战。闻得风声的卫斯理也前来助阵，无奈不敌强大的敌手身受重伤，方天涯及时现身以奇异力量救出卫斯理，两人就此开始一段离奇情缘。

　　著名作家、冒险家卫斯理（许冠杰 饰）在埃及游历时，受到了大富翁霍普的请托，后者请卫斯理寻找他的师兄高大威（泰迪罗宾 饰）。卫斯理在收到高大威主动寄来的信件后，赶赴尼泊尔与其汇合。高大威其时正为青帮龙头白奇伟（狄龙 饰）寻找传说中的喜马拉雅龙珠，眼看成功在即却身陷“邪教”的追杀中，卫斯理帮助高大威潜入宗教内部夺得龙珠，在撤出时飞机失事高大威不知所踪，逃跑失败的卫斯理被带到只有五岁的小佛爷面前，卫斯理受小佛爷感化，承诺追回龙珠，以延续此一教派。
　　返回香港的卫斯理再遇霍普助手，并拒绝向对方交出龙珠，第一时间赶到白公馆，白奇伟之妹白素（王祖贤 饰）是卫斯理的书迷，在白素帮助下，卫斯理取得龙珠，但是一场三方围绕龙珠的争夺战才刚刚开始……